Cinq choses que nous ne savons pas sur omicron : Semaine du 29 novembre

5 choses à savoir en sciences de la vie

Cette semaine, il est inévitable de ne pas parler d’omicron et nous avons donc décidé de consacrer notre numéro des « 5 choses en sciences de la vie » à ce même sujet.

Dans une torsion de tous les articles sur « ce que nous savons » sur la nouvelle variante, cependant, nous avons pensé que la communauté serait mieux servie pour parler de ce que nous ne pas connaissent encore la dernière variante qui est maintenant dans deux douzaines de pays. Voici cinq choses auxquelles nous réfléchissons.

À quelle vitesse l’omicron sera-t-il omniprésent aux États-Unis ?

Dès que la nouvelle de la nouvelle variante a commencé à circuler le 26 novembre, certaines des premières questions posées étaient « omicron arrivera-t-il aux États-Unis ? » et « si oui, quand ? » La réalité est que dans notre économie mondialement connectée et avec un virus aussi transmissible que COVID-19, la réponse continue d’être, oui, toute nouvelle variante apparaîtra aux États-Unis et elle le fera en quelques jours ou semaines. Le monde entier est dans la même situation, et bien que troublant, c’est la nouvelle réalité de notre avenir endémique avec COVID-19. La question devient maintenant, à quelle vitesse omicron remplacera-t-il d’autres variantes ?

Le premier cas confirmé d’omicron aux États-Unis a été identifié à San Francisco le 1er décembre chez un individu vacciné (pas de rappel) qui a quitté l’Afrique du Sud le 22 novembre. Comme pour la plupart des variantes précédentes, une fois qu’elles commencent à circuler, elles devenir la souche dominante, ce pour quoi les virus ont évolué sur le plan épidémiologique. À titre de perspective, l’Institut national sud-africain des maladies transmissibles a déclaré que 74% des génomes COVID-19 séquencés en novembre appartenaient à omicron. Delta était la variante dominante tout au long du mois d’octobre. Le même changement dans les variantes a été observé d’alpha à bêta à delta, et c’est le même changement que nous voyons sur une base annuelle avec la grippe. Il est probable qu’omicron aura un taux d’occurrence élevé aux États-Unis au cours des prochaines semaines, ce qui doit être surveillé et évalué, mais aussi quelque chose auquel s’habituer à mesure que le virus monte et descend. Les précautions telles que le masquage, la distanciation sociale et surtout la vaccination et les rappels, continuent d’être les meilleurs outils pour lutter contre le virus et minimiser la gravité des infections.

Parallèlement à la détermination dans quelle mesure, le cas échéant, l’omicron échappe aux vaccins existants, les fabricants de vaccins ont commencé à lutter contre la variante si nécessaire. Pfizer, BioNTech et Moderna ont indiqué avoir déjà commencé à travailler sur le développement de nouvelles versions de leurs vaccins ciblant cette variante. Ces sociétés ont déclaré qu’elles s’attendent à être prêtes avec un vaccin mis à jour dans les 100 jours. Cela est possible car les plates-formes d’ARNm qu’ils utilisent peuvent être rapidement mises à jour pour coder pour les variantes de la protéine de pointe, tandis que le reste du processus de fabrication reste inchangé. C’est également possible parce que la FDA a déjà publié des directives sur ce qui est nécessaire pour obtenir l’approbation des mises à jour de vaccins pour lutter contre les nouvelles variantes.

Omicron échappera-t-il aux vaccins ou traitements existants ?

Lors de l’évaluation des variantes, l’accent est mis sur les mutations du gène qui code pour la protéine de pointe du virus, qui joue un rôle essentiel dans la capacité de la variante à pénétrer dans les cellules et à échapper aux anticorps. Chaque variante existante préoccupante porte de multiples mutations affectant la protéine de pointe, ce qui soulève la question de savoir si les vaccins ou les traitements existants seront efficaces pour prévenir l’infection. La variante omicron est caractérisée par 30 changements ou plus dans la protéine de pointe. Comme on le voit avec la variante delta, l’efficacité du vaccin est généralement plus faible avec les variantes émergentes (de 89 % en alpha à 79 % en delta lors de la prévention de la maladie symptomatique) ; Cependant, il n’est pas clair dans quelle mesure cette efficacité moindre est attribuable à la diminution de la protection au fil du temps par rapport aux mutations du variant.

Comme on pouvait s’y attendre, les dirigeants du monde entier pèsent sur l’efficacité des vaccins pour se protéger contre la variante omicron. Le PDG de Moderna a prédit que les vaccins existants seront beaucoup moins efficaces contre l’omicron. Dans une interview à Bloomberg Television, le PDG de Pfizer a indiqué qu’il ne s’attendait pas à une baisse significative de l’efficacité du vaccin de Pfizer, mais qu’il faudrait quelques semaines pour que les premières analyses de données reviennent. Bien qu’il ne s’agisse pas d’un vaccin, GSK a indiqué que les données précliniques suggèrent que son traitement par anticorps monoclonal pourrait être efficace contre la nouvelle variante d’omicron. À l’inverse, le PDG de Regeneron a indiqué que son traitement par anticorps monoclonal pourrait être moins efficace contre la nouvelle variante d’omicron.

Comme en témoigne la diversité existante des opinions, il faut plus de temps pour développer des informations basées sur des données sur l’efficacité des vaccins et des traitements existants contre la variante omicron.

L’omicron est-il plus transmissible que le delta ?

Des études épidémiologiques sont en cours mais à ce stade, il est trop tôt pour déterminer si l’omicron est plus transmissible. De nombreux facteurs contribuent à la transmission d’un virus, notamment les conditions environnementales, la charge virale, le comportement de l’hôte, le mécanisme de défense de l’hôte et l’infectivité du virus. Ces facteurs diffèrent selon les régions et les populations. Jusqu’à ce que d’autres études soient terminées, il est trop tôt pour déterminer si l’omicron sera plus transmissible que le delta à l’échelle mondiale.

Le 26 novembre, l’Organisation mondiale de la santé a classé l’omicron parmi les variantes préoccupantes (COV). L’OMS a une définition de travail pour la façon dont ils classent les COV. Sur la base d’un groupe d’experts indépendants, ils ont déterminé que les preuves préliminaires suggéraient un risque accru d’infection pour cette variante, par rapport aux autres COV, dans presque toutes les provinces d’Afrique du Sud. Il n’y a pas d’informations actuelles suggérant que les symptômes de l’omicron diffèrent significativement des autres variantes. Les données préliminaires de la région indiquent un taux d’hospitalisation accru, mais cela pourrait être lié à un nombre accru de personnes infectées et devra être étudié plus avant pour déterminer si cette variante augmentera la gravité de la maladie.

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