Qu’est-ce que cela signifie qu’un virus devienne «endémique»? – AIER

– 25 janvier 2021 Temps de lecture: 5 minutes

Nous avons déjà oublié que nous avons aplati la courbe pour permettre à la capacité hospitalière d’augmenter. Le but supposé des verrouillages n’était pas d’arrêter le virus mais simplement de mieux rationner les ressources médicales.

Nous avons déjà négligé le bon sens de la déclaration de Great Barrington.

Nous avons déjà raté l’opportunité que nous offraient les vaccins pour réhabiliter l’interaction sociale et l’économie.

Et maintenant, si nous ne parvenons pas à reconnaître le moment où Covid devient «  endémique  » et à passer à autre chose, la société sera bloquée jusqu’en 2023.

Même si vous verrouillez la société pendant deux semaines (ou deux mois), cela ne fera aucune différence. Covid ne partira pas de sitôt. En fait, cela restera une partie de nos vies. Les professionnels de la santé commencent à reconnaître que Covid rejoindra probablement la liste croissante des maladies endémiques.

Même Joe Biden a fait allusion dans cette direction dans ce qui est l’une des aveux les plus francs de tout élu au cours des 10 derniers mois: «Nous ne pouvons rien faire pour changer la trajectoire de la pandémie au cours des prochains mois.»

Une maladie est considérée comme endémique lorsqu’elle est régulièrement trouvée parmi des populations particulières ou dans une certaine zone géographique, et est «constamment maintenue à un niveau de base […] sans entrées externes. » L’endémicité signifie prévisible et gérable.

La poliomyélite était endémique. La varicelle est endémique dans le monde entier. Le VIH est endémique aux États-Unis. Ebola est endémique en RDC, tandis que le paludisme reste endémique dans diverses régions d’Afrique, d’Asie et d’Amérique latine.

Covid-19 sera le cinquième coronavirus humain à finalement atteindre un état endémique. Les quatre autres coronavirus – tels que ceux qui causent le rhume – offrent une immunité à court terme d’une durée d’environ un an. Cependant, une étude récemment publiée indique que les immunités Covid-19 durent au moins 8 mois, ou pendant des années.

Graham F. Medley de la London School of Tropical Hygiene, et la coauteure Anna Vassall différencient les maladies épidémiques et endémiques, et décrivent les premières comme «généralement[ing] mortalité et morbidité plus élevées que les maladies endémiques, en raison d’un manque d’expérience et de connaissances cliniques, ainsi que d’une pathogénicité innée. » Quand les maladies émergentes deviennent endémiques, Medley et Vassal disent:

[T]Ils deviennent de plus en plus tolérés et le lieu de responsabilité peut se déplacer vers l’individu. Au lieu que les autorités publiques détectent activement les cas et subventionnent la protection contre les risques, les gens peuvent être de plus en plus encouragés à payer pour les moyens de gérer leurs propres risques et de rechercher des soins.

Un collègue professeur à la London School et président du Groupe consultatif stratégique et technique de l’OMS sur les risques infectieux, le Dr David L. Heymann, a déclaré que Covid deviendrait probablement endémique – et continuera à muter, tout comme les coronavirus que nous avons déjà et pour lesquels de nouveaux vaccins contre la grippe sont développés chaque année.

Malgré de nombreuses et étendues restrictions – y compris des restrictions de voyage empêchant l’introduction de nouveaux cas, des limites de capacité et des interdictions de grands rassemblements pour empêcher la transmission – Covid a maintenu une présence constante dans de nombreux pays. Covid n’est pas nécessairement «hyperendémique» avec des taux d’occurrence constamment élevés comme le décrit cet article, mais fluctue pendant les mois plus froids de la même manière que les fluctuations observées avec la grippe.

La présence continue de Covid – et les niveaux croissants d’immunité collective grâce aux vaccins et à l’infection naturelle utilisés dans les définitions techniques strictes du terme «  endémique  » dans les modèles épidémiologiques de SIR – malgré le manque d’intrants signifie qu’il devrait bientôt être considéré comme endémique.

La possibilité que Covid devienne endémique a été reconnue dès le 13 mai 2020 par le directeur exécutif du programme OMS pour les urgences sanitaires, le Dr Michael Ryan [at 1.02.06]:

Je pense qu’il est important de mettre cela sur la table: ce virus pourrait bien devenir un autre virus endémique dans nos communautés. Et ce virus pourrait ne jamais disparaître. Le VIH n’a pas disparu, mais nous avons accepté le virus, et nous avons trouvé les thérapies et nous avons trouvé les méthodes de prévention, et les gens ne se sentent plus aussi effrayés qu’avant. Et nous offrons la vie – une vie saine et longue – aux personnes vivant avec le VIH. Et je ne compare pas les deux maladies, mais je pense qu’il est important que nous soyons réalistes. Et je ne pense pas que quiconque puisse prédire quand ou si cette maladie disparaîtra.

Sa réponse montre qu’une grande partie d’une maladie devenant «endémique» exige que la société s’y confronte. Plus tôt nous reconnaîtrons Covid comme endémique, plus vite nous pourrons surmonter cette hystérie sans entraves.

Il y a un problème: les tests. Si nous continuons à tolérer un grand nombre de faux positifs, nous créons l’illusion d’une crise continue même lorsque la réalité est différente. Alternativement, ces faux chiffres peuvent nous faire croire qu’une maladie a atteint un état endémique alors qu’elle ne l’a pas encore fait.

Comme New York Times journaliste Apoorva Mandavilli a expliqué en août, le nombre de cycles, le «seuil de cycle», utilisé pour traiter les tests PCR varie. L’épidémiologiste de Harvard, le Dr Michael Mina, explique que les tests PCR,

amplif[y] matière génétique du virus en cycles; moins il faut de cycles, plus la quantité de virus est importante, ou charge virale, dans l’échantillon. Plus la charge virale est élevée, plus le patient est susceptible d’être contagieux.

Tout au long de Covid, la plupart des tests ont été traités à 40 cycles, certains atteignant 45 et certains à 37. Mais le nombre de cycles utilisés est généralement omis des résultats fournis aux patients et aux médecins. La virologue Juliet Morrison a été «choquée» que les résultats de tests avec des cycles aussi élevés aient été utilisés pour représenter un résultat «positif». Le Dr Mina était d’accord,

Les tests avec des seuils si élevés peuvent détecter non seulement des virus vivants, mais aussi des fragments génétiques, des restes d’infection qui ne présentent pas de risque particulier – un peu comme trouver un cheveu dans une pièce longtemps après le départ d’une personne.

Selon Les temps, même le CDC a reconnu l’année dernière que «il est extrêmement difficile de détecter un virus vivant dans un échantillon au-dessus d’un seuil de 33 cycles» et a déclaré que l’agence collaborerait avec la FDA sur les mesures de seuil «pour les décisions politiques».

Cette surabondance de prudence dans les tests a conduit à une surestimation par dix des cas dans tout le pays: Mandavilli dit que sur 45 604 cas, peut-être seulement 4 500 ont des proportions suffisamment importantes de virus pour être considérés comme infectieux.

Une revue au Wadsworth Center (laboratoire de l’État de New York) sponsorisé par Les temps de réexaminer 872 tests positifs précédemment traités à un seuil de 40 cycles, a constaté qu’à un seuil inférieur de 30 cycles (un taux plus modéré), plus de 60% des cas ne seraient plus considérés comme positifs. De plus, leur examen a révélé que,

Dans trois ensembles de données de test comprenant des seuils de cycle, compilés par des responsables du Massachusetts, de New York et du Nevada, jusqu’à 90% des personnes testées positives ne portaient pratiquement aucun virus.

Fournir des informations sur les seuils de cycle aux patients et aux médecins pourrait améliorer les conseils donnés aux individus sur l’opportunité de s’auto-isoler et réduire considérablement le besoin de recherche des contacts.

Réduction des cycles de seuil de PCR à la normale, raisonnable des niveaux, disons, inférieurs à 30 cycles contribueraient grandement à exclure les résultats faussement positifs qui captent des fragments génétiques de virus mort. Cela réduirait les nombres pour refléter plus précisément le nombre de infectieux individus dans la société ainsi que le nombre de décès avec Covid est actuellement présenté à tort comme de Covid.

Par rapport aux gros titres de l’année précédente, les médias ne seraient plus en mesure d’agir comme une corne de brume de la peur. Les citoyens pourraient devenir de plus en plus tolérants vis-à-vis du virus, et la responsabilité du risque personnel et des décisions d’accès aux soins médicaux appartiendra à nouveau aux individus.

***

Merci beaucoup à Dr Jay Bhattacharya pour m’avoir fait remarquer que, dans le langage technique des modèles SIR, l’endémicité nécessite l’acquisition d’un niveau d ‘«immunité collective», que nous n’avons pas atteint dans de nombreux endroits.

Micha Gartz

micha gartz

Micha est chercheur associé à temps plein à l’American Institute for Economic Research. Elle poursuit actuellement sa maîtrise en relations internationales et sécurité nationale à l’Université Curtin, où elle a obtenu un double diplôme en relations internationales et en économie.

Au cours de ses études, elle a participé à de nombreux extrascolaires en tant que secrétaire du Curtin Wall Street Club, participante au programme Wesfarmer High Achievers de la Curtin Business School et stagiaire à la West Australian Chamber of Commerce and Industry. Elle a reçu des bourses complètes pour le programme de développement du leadership de Mannkal, un stage avancé dans l’industrie à l’American Institute for Economic Research et l’école d’été 2018 Asia Institute for Political Economy, organisée par le Fund for American Studies.

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